Институт ЕврАзЭС посткеңестік кеңістіктегі интеграциялық және өркениеттік үрдістерді зерттеу және талдау мақсатында құрылған.
ЕврАзЭС Институтының Жарғысына сәйкес, оның қызметтерінің негізгі қағидалары ретінде болып жатқан үрдістерді бағалауға ғылыми-сараптамалық әдістің басым болу және мемлекеттік органдар мен саяси құрылымдардың тәуелсіздігі қарастырылады.
Институттың барлық зерттемелері, қолданбалы және құрылымдық бағытта. Сынау, жарыссөздер және пиар – біздің қолданатын стиліміз емес. Біз Ресейдің және интеграция бойынша басқа да серіктестердің негізгі мәселелерін шешу нұсқасын іздестірудеміз. Институт сол себептен, ЕврАзЭС, ТМД; ОДКБ, ШОС, Белоруссия және Ресей және т.б. ұйымдармен тығыз қарым-қатынаста және әріптестікте жұмыс атқарады. ЕврАзЭС Институтының басым серіктестерінің қатарына Еуразиялық экономикалық комиссияның Ғылыми-сараптамалық кеңесіде кіреді (Белоруссия, Қазақстан және Ресей КЕдендік Одағы комисиясының секретариаты), М.В.Ломоносов атындағы ММУ гуманитарлық факультеттері (философия, саясат және тарих), ММХҚИ — Ресей СІМ Университеті, Бейбітшілікті қорғау бойынша Ресей комитеті, ЕврАзЭС атқарушы органдары, ҰҚКШҰ, ШЫҰ және ТМД, Мемлекеттік Дума және Федерация Кеңесінің бейіндік комитеті, Геосаясат мәселелерінің Академиясы, Ресей ғылым академиясының аймақтық әкімшіліктері және институттары, Еуразиялық экономикалық интеграция, модернизация, бәсекеге қабілеттілік және тұрақты даму кешенді мәселелері бойынша РҒА Ғылыми Кеңесі.